ビフィズス菌は、乳糖やオリゴ糖などを分解して乳酸や酢酸を産生して腸内のpHを顕著に低下させ、善玉菌として腸内の環境を整えるほか、花粉症などアレルギー症状の緩和にも貢献していることが分かってきた。
乳幼児に多いロタウイルスによる感染性腸炎の抑制をする可能性が報告されている。
ビフィズス菌は、パントテン酸（B5）をそのまま利用できずパンテチンを必要とし、また、リボフラビン（B2）を必要とするとされる。
ビフィズス菌（B. infantis、B. breve、B. bifidum、B. longum及びB. adolescentisのすべて）で菌体内にビタミンB1、B2、B6、B12、C、ニコチン酸（B3）、葉酸（B9）及びビオチン（B7）を蓄積し、菌体外にはビタミンB6、B12及び葉酸を産生した。
ヒト（成人）の腸内の平均量のビフィズス菌の推定ビタミン産生量はビタミンB2、B6、B12、Cおよび葉酸で所要量の14-38%を占め無視できない割合と考えられる。
ただしビタミンB12だけについては、内因子と結びついたビタミンB12が吸収される回腸の部位からさらに遠位の大腸でビタミンB12が産生されているので、ヒトは大腸で作られたビタミンB12を十分に吸収することができない。
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